using System;

public class Program

{

    public static void Main()

    {

        // входящие данные

        string data = "0x00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 30 39 ..............09";

        // получаем позицию первой найденной точки

        int endIndex =  data.IndexOf(".");

        // получаем позицию первого вхождения символов 00

        // с конца строки начиная с endIndex

        int startIndex = data.LastIndexOf("00", endIndex) + 2; // + размер искомых символов

        // выделяем часть строки и удаляем лишние пробелы по бокам

        string result = data.Substring(startIndex, endIndex - startIndex).Trim();

        // выводим результат

        Console.WriteLine(result);

    }

}